一.国家方针根据不一样
1.国家高新科技企业明确解决方法是为帮扶和鼓舞高企认定的进行，根据《我国企业企业所得税法》.《我国企业企业所得税法执行法案》，国家基本常识产权年限发展战略进行整体规划.我国添加国际经济组织（WTO）等一系列方针的要点与配套设施方针颁布下问世，主要是整体规划.正确引导企业的生产.科学研究.日常规则等规范性，切合国家有关发展战略构思。
2.软件企业明确解决方法是有关遵循国务院办公厅鼓舞软件工业和集成电路芯片工业进行多个方针实施方案，进一步深化当地软件工业和集成电路芯片工业的进行，融合当地具体情况，拟订的有关方针。
软件工业是基本常识经济发展时期的核心工业，对推动经济发展进行具备非常重要的战略地位。应用市场经济体制，提升资源分配，鼓舞独立标新立异，通过在方针.资产上应当特别适用，推动软件工业的坚持创新驱动进行，坚持不懈软件工业在全国各地的领先水平，并快速提高或靠近国际性领先水准。  

二.政府部门审阅一部分不一样
1.高新科技企业明确由各省市.自治州.市辖区.省级城市高新科技行政处理一部分同区级财政局.税收一部分协同鉴定；
2.软件企业由地区科委或科技厅承担鉴定。
三.有效期和工商年检标准不一样
1.高新科技企业有效期为三年，三年复核，第六年再次明确。拟明确的高新科技企业每一年按照有关标准报统计分析和科技委备案，一起在地区企业企业所得税免减所解决免减备案。
2.软件企业执行每一年年审，根据软件企业解决方法标准的指标值和原材料，给予有关原材料，每一年的六月份以前解决软件企业年审，倘若通过了，可以享受上一本年度的企业企业所得税免减，倘若沒有通过，不可以最享受企业企业所得税免减。
四.所享受的企业企业所得税特惠不一样
1.高新科技企业明确后，在国家税务局备案后，企业企业所得税为15%，免减10%。企业必须每一年在工商局做高新科技企业备案，通过后，才能享受到特惠方针。
2.软件企业明确，在税局备案后，自盈利年起，第一年和第二年免税企业企业所得税，第三年至第五年折半征缴企业企业所得税。享受完五年特惠后，不会再享受一切企业企业所得税特惠方针（包含高新科技企业特惠方针），企业企业所得税按照25%征缴。
五.所享受的别的特惠方针不一样
（一）高新科技企业可享受的别的特惠方针
1.经明确的国家高新科技企业，每一年可要求解决北京户籍；人才引进方针；
2.经明确的国家高新科技企业为开发技术性.新品.新技术新工艺产生的探讨开发设计花费，未组成无形资产摊销记入损益类的，在按照标准按实扣减的根基上，按照讨论开发设计成本的50%加计；组成无形资产摊销的，按照无形资产摊销成本的150%摊销费；
3.经国家科委明确的高新科技企业，包含但不限于在国家的一些帮扶科技项目申报部件协助，有的新项目要求还强制性规定需要有国家高新科技资质证书才能要求；
4.企业高端解决工作人员回京，按照上一本年度所缴本人工薪阶层收益企业所得税地区留成一部分的80%给予奖励，用以其在当地买房.买车及其参加学习培训。（《北京市招引高档人才奖赏处理规则实施办法（京人发[2005]57号）》.《关于北京市招引高档人才奖赏处理规则的告诉（京政办发[2005]18号）》）；
5.对在高新科技科技成果转化中作出杰出贡献的技术专业专业技术人员和解决工作人员，市人民政府授予光荣称号并给以奖励，所得奖金免税个人所得税。（《北京有关进一步推动高新科技工业进行的多个标准》）。
（二）软件企业可享受的别的特惠方针
1.根据企业自行的标准，软件企业从业者公积金的存缴市场份额可提升到20％；
2.凡担任于当地软件产业基地或软件企业，具备大学本科及本科以上学历且得到高端技术专业专业技术职称的或在世界各国得到项士及上面学士学位的软件技术专业专业技术人员和解决工作人员，可由用人公司按照相关标准，立即解决调京办理手续，其恋人及未成年子女可使调.随迁；
3.从部门预算中分配项目资金，用以软件企业高端解决工作人员和工程师开办高新科技企业或提升本企业自有资金产出和本人第一次买住宅.小汽车的经济补贴，补贴标准不超过本人本年已纳个人所得税的80％；
4.对国家整体规划合理布局内的关键软件企业，如当初未享受免税政策优惠待遇的，减征10％的征收率征缴企业企业所得税。